- Bệnh phình bụng: Nguyên nhân là do sức khỏe cá kém, cho cá ăn thức ăn không đảm bảo chất lượng làm cá không tiêu hoá được thức ăn, bụng cá trương to, ruột chứa nhiều hơi. Cá bơi lờ đờ và chết rải rác.

- Bệnh nấm nhớt: Bệnh này do nấm thủy mi gây ra, còn gọi là bọ gòn hay nấm da, nấm mốc. Khi cá phát bệnh đang bơi trong nước, ta thấy trên thân cá có những đốm trắng giống như bông gòn và da cá tiết nhiều nhớt. Nguyên nhân gây bệnh là do tiết trời trở lạnh, môi trường nước ao nuôi bị ô nhiễm, tạo điều kiện cho nấm thủy mi phát triển.

- Bệnh do ký sinh trùng: do ký sinh trùng có tác động mạnh đến cá con.

- Bệnh xuất huyết: Bệnh do vi khuẩn Aeromomas hydrophilla hoặc Edwardsiella Tarda gây ra. Cá có dấu hiệu toàn thân bị xuất huyết, hậu môn sưng lồi, bụng trương to, có dịch vàng hoặc hồng, đầu và mắt cá sưng và lồi ra.
- Cá chết do mật độ dày: Hiện tượng này thường xảy ra ở các ao nuôi với mật độ quá dày. Cá chết không có dấu hiệu bệnh lý, chỉ nổi lờ đờ và chết hàng loạt.

- Bệnh đen thân: có thể gây chết rất nhiều ở cá rô đồng đây là hiện tượng bệnh khá nghiêm trọng được xem như là một hội chứng, đã xảy ra tại nhiều hộ nuôi vùng Đồng bằng sông Cửu Long. Để chữa bệnh này thì ta phải có quy trình chữa bệnh cụ thể từng môi trường và giai đoạn phát triển của cá. Khi cá bị bệnh có thể xử lý bằng các sản phẩm có hợp chất Povidone Iodine là hỗn chất của Polyvinylpyrrolidone và Iodine. Sản phẩm có thể ở dạng dung dịch hoặc dạng bột có nồng độ hoạt chất từ 11-15%. Dạng dung dịch có thể dùng với liều 1-2ml/m3. Dạng bột dùng 1-1,3mg/m3 (hoà tan với nước trước khi dùng) để diệt tác nhân gây bệnh rất có hiệu quả. Song song đó, ta cần bổ sung thêm các sản phẩm thuốc bổ gan cho cá, kích thích dinh dưỡng. Sau thời gian xử lý môi trường bằng hoá chất (Povidone Iodine), ta phải xử lý môi trường cho sạch bằng các loại sản phẩm vi sinh.