Tổng thiệt hại do thiên tai xảy ra trong năm 2006 lên tới 18.566 tỷ đồng (tương đương hơn 1,19 tỷ USD). Các đợt bão lũ làm 339 người chết, 274 người mất tích (riêng bão Chanchu 246 người), 2.065 người bị thương.

Bão lũ cũng gây thiệt hại nặng nề chưa từng có cho ngành sản xuất nông nghiệp và thủy sản với tổng diện tích lúa bị ngập lên tới 140.000 ha (trên 21.000 ha bị mất trắng), hư hại 122.000 ha hoa mầu…; hơn 10.000 ha nuôi trồng thủy sản bị ngập; trên 2.000 tàu thuyền bị chìm và hư hại.