Hội nghị thống nhất đánh giá, năm 2006, dịch bệnh diễn biến phức tạp trên lúa, đặc biệt là sâu cuốn lá nhỏ, sâu đục thân (ở các tỉnh đồng bằng sông Hồng), rầy nâu, bệnh vàng lùn, lùn xoắn lá, bệnh đạo ôn (ở các tỉnh phía Nam). Ngành Bảo vệ thực vật đã thông báo, dự báo khả năng gây hại, đề ra các giải pháp kỹ thuật phù hợp, chủ động trong việc phòng chống; tổ chức hướng dẫn nông dân phòng trừ có trọng tâm, trọng điểm, hạn chế tác hại của dịch bệnh, bảo vệ sản xuất, góp phần vào thành công vụ hè thu, thực hiện tốt chương trình an ninh lương thực quốc gia.

Ngành cũng tiến hành 566 đợt thanh tra, kiểm tra các cơ sở sản xuất, kinh doanh thuốc bảo vệ thực vật, phát hiện 2.350 cửa hàng, đại lý (trong tổng số 14.752 lượt cơ sở được kiểm tra) đã vi phạm các quy định về kinh doanh (chiếm gần 16% số cửa hàng, đại lý được thanh tra). Những vi phạm chủ yếu là cơ sở không đủ điều kiện kinh doanh, thuốc không đúng nhãn mác, quá hạn sử dụng, kém phẩm chất, ngoài danh mục... Thanh tra chuyên ngành tiến hành xử lý vi phạm, bằng hình thức phạt tiền, tổng số 762 cơ sở, cá nhân kinh doanh, tịch thu 962.588 lít, gần 4.000 kg thuốc bảo vệ thực vật vi phạm. Hiện nay, tại chi cục bảo vệ thực vật các tỉnh còn tồn đọng gần 70.000 kg, 36.823 lít và 3.914 bao bì thuốc bảo vệ thực vật cần phải tiêu huỷ.

Năm 2007, ngành Bảo vệ thực vật sẽ tập trung theo dõi, nắm chắc diễn biến tình hình thời tiết, cơ cấu giống, lịch thời vụ… để dự kiến thông báo tình hình phát sinh dịch hại trên cây trồng. Trong đó, đặc biệt lưu ý phòng, chống rầy nâu, bệnh vàng lùn, lùn xoắn lá trên cây lúa, cây thực phẩm, cây công nghiệp ngắn ngày, cây ăn quả, cây công nghiệp dài ngày… phấn đấu dự báo sớm trước các cao điểm phát sinh dịch hại từ 15 đến 20 ngày; Đồng thời, tăng cường kiểm tra dịch hại ở vùng trọng điểm, thông báo kịp thời và hướng dẫn bà con nông dân phòng, trừ có hiệu quả, quyết tâm giành thắng lợi trong sản xuất nông nghiệp năm nay.