Theo các bài thuốc cổ truyền, linh chi có tác dụng trị chứng bí tiểu, ích thận khí, có vị mặn, tính bình, không độc hại. Các chế phẩm từ linh chi còn được dùng để điều trị nhiều bệnh như giảm và điều hòa huyết áp, kìm hãm quá trình phát triển ung thư và HIV, suy nhược cơ thể, giảm đường huyết, giảm đau, giải độc trong cơ thể, giảm cholesterol trong máu, mất ngủ, loét dạ dày, làm tăng hệ thống miễn nhiễm của cơ thể, chữa tê thấp, làm da mặt thêm mịn....

Trong các loại linh chi, linh chi đen được xếp vào 1 trong 6 nhóm quý nhất (lục bảo linh chi).